太宗只好对侯君集说：“与公长诀矣，而今而后，但见公遗像耳！”说罢，潸然泪下。侯君集也磕头表示服罪。

侯君集因谋反被杀，并没收了他所有的家产。临刑前，侯君集从容不迫，对监斩官说：“君集岂反者乎，蹉跌至此！然尝为将，破灭二国，颇有微功。为言于陛下，乞令一子以守祭祀。”

太宗闻之，特意开恩，留下了他的妻子和一个儿子，将他们迁到岭南。

历史上的侯君集有三个儿子，但是在这个世界上侯君集却只有一个女儿，如今犯了这等十恶不赦的重罪，侯家基本上也就算是破落了。

纵观侯君集一生，起步平庸，但在争战年代，始终效命于太宗，所以能够平步青云，后来率军远征，克敌制胜，确实有功于国，然而他又弃前功而构后罪，贪赃任性，直至图谋造反。

侯君集也确有宰相之才，魏征就曾向太宗推荐过侯君集，让他任仆射，并说：“国家安不忘危，不可无大将，诸卫兵马宜委君集专知。”

但太宗认为君集喜欢自我夸耀，所以没有重用。

侯君集一直作为太宗的忠实追随者而备受器重。他和秦叔宝、尉迟恭不同，不是以骁勇而充当太宗的打手，他又和李靖，李世绩不同，他从头到尾都是秦府的人。同时，他的祖辈是关陇军事贵族集团中的成员，这也是他受信任的一个重要原因。

在玄武门之变中，侯君集扮演了一个非常重要的角色，促使太宗的最终决策，并且是太宗进入玄武门随行九人之一。史称“建成、元吉之诛，君集之策居多”。这从事后的封赏也可看出，侯君集食邑千户，仅次于尉迟、房、杜、长孙几人，而在诸将之上。

太宗即位后，侯君集一直握有很大的兵权。贞观四年，又以兵部尚书参与朝政而入相。他虽然出身行伍，但是被重用后，开始认真读书，后来他还担任吏部尚书主持典选，工作比较出色，得到朝野的好评。

在原本的历史上，侯君集在贞观时期参与了两次较大规模的战争。第一次是贞观九年由李靖总指挥的灭吐谷浑之战。他在此次战争中担任一支方面军的指挥官，积石道行军总管。战争初期，由于吐谷浑可汗慕容伏允实施坚壁清野的防御政策，致使数道唐军因补给不济而退保鄯州。

这时，鄯州道行军总管任城王李道宗提出：“柏海近河源，古未有至者。伏允西走，未知其在，方马癯粮乏，难远入，不如按军鄯州，须马壮更图之。”

侯君集却以为不妥，他认为：“王师已至，而贼不走险，天赞我也。若以精兵掩不备，彼不我虞，必有大利。若遁岨山谷，克之实难。”

主张趁敌人未注意以精兵追击。这个提议得到主帅李靖的支持。果然，李道宗很快追上了伏允，大败之。后来李靖兵分二路，侯君集和李道宗负责南线战场，李靖、李大亮等北上，李靖部将薛万彻等追伏允至图伦碛深处，成功结束了战争。

这次战争充分显示了侯君集清醒的战场意识以及较出色的指挥才能。虽然侯君集后来担任过防御吐蕃的当弥道行军大总管等总指挥职务，但是最终另他成为李靖以后军队第一号人物的战争是贞观十四年灭高昌之战。

不过现在的历史已经发生了巨大的改变，侯君集如同历史上一样，参与了第一次征讨吐谷浑的战争，但是征讨高昌的却变成了杜睿。不过剿灭薛延陀的一场大战，却成为了他人生的另一个亮点。

如果没有今天这件事情发生的话，或许侯君集的人生就完全不一样了，但是现在，一切的一切，说什么都太晚了。