三月，将军义辉公卷土重来，七万幕府军布阵户石城。宪义公当即领兵五万，布阵前山城。

当是时，幕府军爆发疫病，然上杉军得以控制，幕府军骤然溃败，大军西遁。

宪义公再攻户石城，未克，国崩亦无效，引兵而归。

六至十月长雨，庄稼毁坏，百姓困苦，宪义公亲自赈灾。

弘治七年，三月十三日，宪义公攻伐信浓，义辉公因病无法亲征，由三管领以及和田惟政领兵两万五千，与辉虎公三万汇合，救援武田氏。

三月二十四日，三好长庆率军突袭，义辉公带病出征，以一万五千对阵三好两万五千，兵败摄津，将军义辉公死于乱兵之中，辉若丸在奉公众保护下逃离京都，远赴近江朽木谷。此为弘治之变！

四月二日，消息传至信浓，幕府军当即撤离，回援义辉公。

辉虎公与武田氏共守户石城，未克，宪义公引兵而还。

有归还者带回将军遗诏，曰：吾之后，天下何人是内务对手？上杉者，本吾足利外戚也，今内务之妻，亦为吾之义妹也。

天下，有德者居之，吾愿吾义妹与内务之嫡长子可为源氏长者，愿内务善待吾子。

此诏被三管领秘密焚烧，然和田惟政与三渊藤英设计逃离京都，最终只有和田惟政到了越后，将此事告知辉虎公。

辉虎公又惊又怒，大呼一声之后，竟吐血昏厥。

辉虎公大病三日，随后与关白一起拜访宪义公，宪义公听闻此事，曰：此三贼也，吾必杀之！

十至十二月，大旱，作物有损。

弘治七年改永禄，是为永禄元年，武田氏当主晴信投降，削发出家为信玄，让位其资义信，领有甲斐半国。