近畿地区则是源于伊贺国的百地丹波袭击了参加“大普请”修路运动的民夫，这招致幕府名正言顺的讨伐，可是加藤光泰、拜乡家嘉、山内一丰连番出击一直未得取得进展，两个月内只消灭不到五百人反而伤亡了接近一千。

同时九州的肥后、肥前地区也爆发了抵制检地的暴动。同样是新领主武田胜赖可就不如德川家康远矣，他面对乌合之众的乱民是每战以寡破众轻松取胜，但越打敌人兵力越多，陷入“人民战争的汪洋大海”，不得不向幕府求助。

适逢幕府的初代御台所忽然重疾，迅速离世，寿数不足四十。将军亦受冲击，意志精神颇为消沉。

平手义光为母服丧之后，接过众人，先是集结了二万旗本军，征召二万农兵，再调动三万外藩联军，兵分五路围了水泄不通，作势踏平伊贺。

藤林正保等少数人早早降伏，多数国人豪族坚决抵抗。

小小伊贺一国，绕着边境走一圈只需要一天时间而已，讨伐军却是花了三个月水磨功夫消耗，才拿下来。

当地的百姓和僧人，不知道是忍者冒充，还是胆子够大，居然屡次对大军发动夜间偷袭作战，甚至老幼妇孺都上阵。

幕府二代目某位爱妾之父，伊势国百姓中野氏，新收了个义子叫做“风太郎”的，也被特别赋予备大将身份。结果在驻扎时对“无辜百姓”缺乏戒心，遭到一群妇人和孩童的攻击，不幸被锄头砍中脖子身亡。

闻此义光大发雷霆，宣布在百地丹波的势力范围内实行“焦土”策略。

三个月间，有至少两万人受诛杀，伊贺国西半部分变成人间地狱，白骨露于野，生民百余一。

这群重视自由胜过生命的山民们，终于不再能反抗了。

约十万石的土地，五成纳入了直辖，三成封赏给有功谱代，剩下的作为对外藩出战的奖励下发。

接着平手义光来到九州，发现肥前、肥后恐怕有上十万人参与了一揆，也想不出什么办法。

在伊贺偏鄙山林做过的事，显然不方便在九州再来一遍。

这并不完全是武田胜赖措施不当造成的，甲斐宗运的忽然死亡也有很大影响。肥后失去了这根支柱，好像有点控制不住。

幸好这时候，当地人锅岛直茂上门求见，献上良策，并且冒着风险亲自前往实施，利用调略手段，挑动了一揆众当中的切支丹信徒和传统神佛信徒自相残杀，精神层面瓦解了敌人。