袁慰亭根据王士珍事先的策划下达了命令，“所有火车都停运，铁路公安全部武装起来，保护车站。加派巡视车辆，防止有人破坏铁路！”

高丽人对于火车和电报的接受程度比较高，因为推行这些不是洋鬼子，而是身为上国的中国。这些体积庞大，外形可怕，威力无比的东西也的确改变了高丽人的生活，至少出远门的时候无须再那么辛苦。所以高丽暂时还没有大范围出现铁路破坏风水、骚扰祖坟的说法。这倒是值得庆幸的事情，如果高丽国内这种说法大范围扩散的话，保护铁路的工作要比现在困难很多很多。

4月30日，骚动的士兵们围攻了兵曹判书闵谦镐的宅邸。除了大肆抢掠之外，还一把火烧了兵曹判书闵谦镐的宅邸。闵谦镐家存放了不少锦缎、香料、药材，一把火过后“芳烈闻数里”。此时高丽四个月没下雨雪，当天晚上就下起了大雨。在汉城里面都认为是这是老天爷表示士兵们是有冤屈的。

第二天，5月1日，士兵们脑子终于冷静下来之后才发现自己犯了大罪，他们赶紧跑去大院君的府邸，请求大院君出面说情。大院君公开的表现是怒斥士兵们胆大妄为。可事情远没有那么简单，闹事的士兵们并没有走投无路而自暴自弃。他们先是回营准备，然后趁着夜色突然出发抢夺了别技军的武器库。

5月2日，闹事顺利的发展成兵变。大量的手工业者、小商人、城市贫民等汉城普通市民加入了这次起义，使“兵变”迅速转化为社会矛盾总爆发的“民变”。

随着反闵排日的情绪被全面点燃，起义士兵和市民先到东别营，占据武库，夺取武器武装自己，然后兵分三路展开行动：一路袭击捕盗厅和义禁府，释放被关押的金春永、柳卜万等士兵和其他犯人，以及著名的卫正斥邪派儒生白乐宽，这位由于上疏反对开放政策而被闵妃集团逮捕。

救出同袍后起义士兵和市民又顺路捣毁了闵台镐、闵泳翊等外戚权贵以及与日本人有交往的人士的府邸，高呼着“杀光闵氏”的口号；一路袭击别技军军营所在地——下都监，处死日本籍教官堀本礼造，一路则占领京畿监营。

当闵氏集团已经失去了控制汉城的武装之后，部队与起义民众一起攻打附近的日本公使馆，声言将尽屠倭人。

中国之所以默许了高丽别技军请日本教习，是因为这帮日本教习不过7人。他们教给高丽人的是老式步枪的作战方法，中国自己完全淘汰了老式步枪，这种武器已经没有什么威力可言。更重要的是，这么一来，所有怨恨都集中在了日本人身上。

事情发展也正如中国所料，5月3日，数万名愤怒的起义士兵和市民冲进昌德宫，四处追杀闵妃和闵谦镐等人，闵谦镐终于藏不住了。

当时高宗急宣大院君入宫收拾乱局，大院君在起义士兵和市民的拥护下进入昌德宫。闵谦镐便急忙冲出重熙堂，跪着揪住大院君的衣袍，向大院君求救。大院君只是冷笑，随即大院君身旁的士兵们将闵谦镐“踢落阶下，铳、筑、剑打成肉泥”。闵谦镐被杀稍早前，京畿道观察使金辅铉也在宫中被剁成肉酱。闵谦镐死后，与金辅铉被弃尸在御沟中。

日本公使花房义质也经历过戊辰战争，在起义士兵和市民的猛攻下沉着应战。激战至深夜，围攻的高丽起义者们焚毁了公使馆周围的民房，以断日本人之后路。花房义质被迫烧毁公使馆，与使馆人员28人一路放枪，击毙不少围攻的高丽起义者后冲出一条血路，突出汉城直奔仁川。突围中二十八人的队伍战死六人，剩下二十二人好不容易在仁川找到了一艘前往中国进行贸易的日本船，狼狈乘船返回日本。

5月8日，日本明治政府正式向中国提出抗议，指责中国政府纵容高丽袭击日本使馆。并且声言要出兵惩处参加此次“甲申兵变”的起义者。

日本海军说干就干，5月9日，一支舰队驶出舰队母港吴港，穿过对马海峡直奔釜山港。日本三千多吨的军舰在釜山港外没来得及耀武扬威半天，从北边出现了一支舰队。为首的是第六舰队的旗舰安庆号。14000多吨的战列舰带着9000吨的重型巡洋舰，以18节的速度绕着一艘三千多吨，三艘不到三千吨的军舰高速绕圈子，巨大的炮口瞄着日本军舰。

300炮一炮下去就能让日本军舰沉入大海，中国人很清楚，日本人也很清楚。但是日本海军并没有因此就抱头鼠窜。在对峙的头一个小时里，日本军舰还想凭借14节的速度和中国军舰兜一兜圈子。一个小时后，两艘日本军舰的锅炉在全力运作之后先后发生故障，只能很没面子的趴在水面上动弹不得。

面对日本海军的丑态，中国舰队调转船头向西南而去，目标是中国第六舰队的副港巨文岛。