最后一支准噶尔败兵逃到了铁门关前二十里，依然没有逃离，他们被赶上、包围，最后被全歼。

僧格以及他手下的五万人马，除了极少数逃进沙漠和戈壁里的败兵，其余的都被斩杀或俘虏。

身为这支八万联军司令的青海总兵张煌言向皇帝的报捷信中禀报了战果，战后清点出准噶尔叛军尸体一万七千多具，俘虏叛军两万三千余，另外还有大约五千多伤兵俘虏，大部份都被张煌言直接下令让和硕特和乌思藏及叶尔羌兵给就地处决了。

这些伤兵多数都伤的较重，张煌言没那么多大夫和医药救治他们，也没时间把他们留下。他得赶到铁门关，因此对这些叛军伤兵俘虏，未请求皇帝，直接就给下令处决了。五千伤兵中，只有大约千余伤兵还能跟上队伍行军，张煌言留了他们一命。

另外还有大约四千余准噶尔叛军，最后逃进了沙漠和戈壁。

对这些叛军，张煌言留下了一个协五千汉军负责驻守轮台，一面是照顾受伤的联军伤兵，一面是负责追剿这些叛军。

八万联军在这场战斗中也伤亡不轻，青海军和藏南军都是汉军主力，共三万人，此战伤亡一千余人。而三万叶尔羌兵，虽被汉军教头训练，又装备不少汉式火器，但依然伤亡很重，他们主要还是在刚被突袭之时表现混乱，缺少有组织的防御，结果战后清点，伤亡居然达到八千多，其中战死五千余，伤三千余。

两万和硕特和乌思藏军，也一样伤亡惨重。安营时，他们被张煌言安置在汉军的左右两翼，和叶尔羌人一样处于外围。准噶尔突袭，他们最先承受攻击，这两支军队虽然被张煌言收编并带来西征，可对他们并不完全信任，一直提防着他们，他们的军中火器很少。

论装备连叶尔羌军都不如，战后清点，两万人马，伤亡过万。

八万联军，一战阵亡近两万，战斗减员了近三万。

这一战，若不是汉军中流砥柱，僧格确实有可能击败联军。

八万联军对阵五万准噶尔，结果是联军伤亡三万，换来近全歼准噶尔五万人，表面上看是旗鼓相当。但实际上，三万汉军主力，只伤亡千余人，依然保持完好，准噶尔却只余几千败军逃进沙漠，可以说实际上是大获全胜。

张煌言轮台得胜之后，一路上再无阻挡，迅速杀到铁门关下。

铁门关四十里峡谷确实险要，但僧格大军没于轮台，导致铁门关此时只剩下三千守军。面对近近四万多联军杀到关下，他们只能闭关而守。

可张煌言拖着一千多门火炮过来，哪怕这些炮只是山地榴，但也是火炮。

铁门关的求援信使刚出关往吐鲁番赶去，结果张煌言只用了半天时间，就有无数炮弹轰破了铁门关。