但是大屠杀带来的后果也是极为严重的。

大量屠杀华侨对吕宋本土经济产生致命影响，物资匮乏、经济萧条。当局财政状况严重恶化，甚至需要借贷度日。西班牙人忧心中国商船不再到来，会令遥远的美洲受到波及。更大的恐惧是，他们担心明朝政府会进行报复。西菲当局紧急加强战备，但军队士气低落，口粮严重不足。殖民者只能心惊肉跳地等待，马尼拉笼罩在绝望和萧条气氛中。万历三十二年了六月，一批对前途悲观的富人离开马尼拉，举家迁往墨西哥。

西班牙驻吕宋总督阿库尼亚一面做些表面工作，如部分发还华侨商人的财产，发动幸存者给国内写信，企图证明西班牙殖民者“清白”；一面派特使奎瓦携带致广东、福建两省巡抚和其他官员的函件，于当年十二月十日乘船前往澳门，并趁机刺探中国有否进攻吕宋打算的军事情报。考虑到澳门的佛郎机人对中国比较了解，阿库尼亚还写了几封信，详述华侨起义事件，并附上致中国官员函件的副本，让奎瓦分发给澳门的司令官、主教、在政务方面有着较大发言权的耶稣会教士等。

奎瓦一行因遭遇风暴于万历三十三年二月折返马尼拉，二月二十五日又由一百五十名西班牙士兵和一名神父陪同再赴澳门。但佛郎机人出于打击贸易竞争对手的考虑，始终未将函件转交中国方面。

奎瓦等抵达澳门的消息传到漳州，有经常往来漳州和马尼拉的中国富商到澳门与其会见，答应把函件转交中国官员，设法动员华侨继续贸易。奎瓦在澳门了解到，明朝政府已获悉屠杀事件，但全国平静，没有集结舰只进攻马尼拉的迹象。获得这个重要情报后，奎瓦购买了一批军事物资，于五月回到马尼拉。

奎瓦带回的消息令西菲当局忧惧大减，但直至万历三十三年五月，西班牙人望眼欲穿的华商船只仍难觅踪影，相反却从澳门传来消息，中国已经集结一支军队，准备前来兴师问罪，一时间又使西班牙人惊惧不已。

但是，大明终究没有出兵问罪。

明朝未出兵讨伐还有当时现实条件的限制。在西班牙屠杀华人大致同一时期，大明王朝进行了三场大规模战争：在西北的宁夏，西南的播州，特别是从万历二十年开始的长达七年与日本在朝鲜进行的战争。这三场大战明朝都取得胜利，但国家军事和财政能力损耗极大。

大明王朝已经没有能力远征了。

丁云毅充分考虑到了干腊丝人对于大明出兵的畏惧，这才会忽然看起来没头没脑的说出了这么一句话来。

马尔科神父果然面上神色一变，随即放下心来。

身为干腊丝人，他最担心的也是这个。虎贲卫水师的战斗力，已经在收复台湾之战中得到了充分表现，如果借助着这场大捷趁机兵发吕宋，那么吕宋的局势将会变得非常危险。

只是他没有想到，丁云毅不是不想问罪，而是出于两个方面考虑。

第一个方面是虎贲卫水师还没有这个能力进行远征，以虎贲卫水师的能力，防卫住台湾、澎湖二地目前已经到了极限，再行出征吕宋，心有余而力不足。

第二个同样也是很重要的原因，在没有准备的情况下贸然远征只会让吕宋之同胞遭到更加大的伤害和苦难。

丁云毅非常清楚的记得，那个后来改名叫郑成功的郑森，曾经致函爪哇岛巴达维亚的一名华侨，要求他停止与西菲当局进行贸易。他还提出要率兵攻取菲律宾。