从镇南军建军开始，萧如薰就坚持和底层士兵打成一片，坚持越过大将直接对基层军队下达指令，培养军队习惯听从最高指挥的习惯，各种越俎代庖让所有人习惯他的行为。

另外还通过教育士兵识字的机会，长期给士兵灌输忠于最高统治者的理念，从最底层每一个士兵开始做起，告诉他们自己应该效忠的对象是谁，是谁给他们饭吃，给他们衣服穿，一直不曾停歇。

到建国初期，萧如薰不敢说自己多么厉害可以掌握每一个士兵的心，但是至少军中将领要想带兵造反，是聚不起规模的。

很多人的担忧打从一开始就不成立，因为萧如薰从最建军一开始就对军队的思想教育抓的非常彻底，一直不曾放松过。

建国以后，借由权力和地位建立军校，从最开始培养忠心耿耿满脑袋都是效忠皇帝效忠大秦观念的基层军官，计划通过他们给军队进行大换血，一批一批的进入军队基层，逐渐将基层军官全部替换掉。

然后，通过他们直接指挥普通士兵，用识字教育和基层军官的带领，将军队完全培养成效忠皇帝和大秦的军队，任何中高级军官将军都休想用他们来做私事，比如造反什么的。

秦军改组给了萧如薰最好的契机，将军队打散重组，把一千名军校生编入其中，隆武四年又编入一千名军校生。

等隆武五年秦军改组基本完成的时候，三千名军校毕业的基层军官已经把持了一百万秦军正规军当中的相当一部分基层军官职位，而原先的旧军官则向上升级，进一步和基层士兵隔离开了。

而从明年隆武六年开始，每年都会有两千名军校毕业生进入军队里，充实每一支军队的基层军官职位和军队里的要紧职位，在帮助秦军完成近代化的同时，足以将军队牢牢的控制在中央朝廷，控制在皇帝手中。

这支军队是绝对的秦军，而非任何一支私家军队，无论天南海北，都是一样的。

海军也是如此，海军军校毕业生们也将进入大秦皇家海军之中，担任基层军官职位，先实习，后就任，从下往上完成海军的大换血，将江大海等一批镇南军旧将在基层的影响完全抹掉。

让高级将领成为传说，成为尊荣的象征，而非实际掌握军队的存在，这是萧如薰不用屠杀功臣不用杯酒释兵权的原因所在。