1798年，拿破仑·波拿巴（Napoleon Bonaparte）入侵埃及，并与奥斯曼帝国作战，以建立法国在中东的存在，最终梦想与印度的提普·萨希卜（Tippoo Sahib）联手。

虽然长达数年的法奥友谊已经结束，拿破仑一世仍然声称对伊斯兰教抱有极大的尊重，并呼应奥斯曼帝国与法国之间悠久的友好关系：

“埃及人民，你们会被告知我来是为了摧毁你们的宗教：

不要相信这一点！

要回答我来是为了恢复你们的权利和惩罚侵占者，而且，比马穆鲁克人（Mamluks）更重要的是，我尊重上帝、他的先知和《古兰经》……

难道我们不是几个世纪以来，苏丹（Sultan）的朋友吗？”

—— 拿破仑对埃及人的讲话。

拿破仑推翻了马穆鲁克贝伊（Mamluk beys），这些人是名义上受到奥斯曼帝国宗主权支配的埃及实际统治者，但他在整个埃及领土上仍然高举法国国旗与奥斯曼旗帜并列，声称自己对伊斯兰教的热爱，并表示他们是在拯救奥斯曼人免受马穆鲁克人的压迫。

然而，塞利姆三世（Selim III）立即宣告圣战（Jihad），并寻求英国和俄罗斯的帮助，这两个国家都对拿破仑的征服感到威胁。

1799年1月3日，奥斯曼帝国与俄罗斯结盟，随后两天与大不列颠（Great Britain）结盟。

英国借此机会与奥斯曼帝国结盟，以抵御拿破仑的入侵，在1799年围攻亚喀尔（Acre）时由威廉·西德尼·史密斯（William Sidney Smith）海军上将指挥，并在1801年阿布基尔战役（Battle of Abukir）中由拉尔夫·阿伯克龙比（Ralph Abercromby）指挥。

到1802年，法国在中东的力量彻底被击败。

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然而，到了1803年，法国和大不列颠再次开战，拿破仑竭尽全力试图说服奥斯曼帝国在巴尔干半岛对抗俄罗斯并加入他的反俄联盟。

另一方面，俄罗斯也在争取奥斯曼的青睐，并成功于1805年签署了防御性联盟条约（Treaty of Defensive Alliance）。