三月，布尔尼与弟弟罗卜藏筹备兵器、整顿和训练察哈尔右翼四旗兵马。察哈尔都统晋津，附牧察哈尔的喀尔喀公垂扎布也积极支持布尔尼和罗卜藏的反清计划。布尔尼派人联系调驻宣府的察哈尔左翼官兵的同时，又派人策动各旗蒙古王公参加反清起义。原察哈尔所属奈曼旗郡王札木禅积极响应了布尔尼的号召。

不料，他的计划被从嫁的长史辛柱公主所发觉，她暗中派她的弟弟阿济根入京告密。满清觉得事态发展严重，不能不采取对策。于是康熙与太皇太后商量后，派侍卫塞棱赴义州，以议事为名，召布尔尼、罗卜藏入京。布尔尼知道是计策，没有进京，监禁了侍卫塞棱。

三月二十五日，布尔尼、罗卜藏、阿杂里喇嘛、僧额浑津喇嘛、喀尔喀公垂扎布、都统晋津、副都统布达里举事反清，率领数千人的队伍直奔张家口，准备与调驻宣府的察哈尔左翼四旗的散秩大臣禅尔济、一等侍卫阿达、参领舒什兰会师。但是，这三人不敢与满清朝廷对抗。而察哈尔左翼四旗官兵，不顾散秩大臣禅尔济的阻拦，在宣府哗变，毁长城边墙去投布尔尼的队伍。

三月二十七日，布尔尼的起义队伍到达张家口以北的鄂西奚，夺取御马厂和清朝大臣马厂的马群挺进张家口。此时由于京师八旗官兵尽数南征，无力讨伐布尔尼。康熙深忧之时，太皇太后向康熙推荐大学士图海。于是康熙命多罗信郡王鄂札为抚远大将军，图海为副将军，率兵讨伐布尔尼。

图海领命后，与副手周培公一起召集了京师满洲蒙古八旗所有家奴，共数万人，挥师讨伐布尔尼。因为听到布尔尼要进攻盛京救阿布奈的风声，清廷命奉天将军与宁古塔将军严守盛京。与此同时，派理藩院郎中马喇等到漠南东部诸旗征调兵马，科尔沁、阿禄科尔沁，翁牛特、巴林、敖汉、喀喇沁、土默特、扎鲁特诸旗王公纷纷请求出兵。

四月，鄂札率兵出征，在开往张家口的途中，周培公让图海以金银珠宝诱惑士兵，每到州县村堡，即令家奴抢掠一番，快到察哈尔境内时，又以察哈尔数百年基业，珠宝不可胜数，若能获取终身富贵来鼓舞士气，清军人人士气高涨。

四月二十一日，图海队伍到达禄时，布尔尼埋伏于山间，列阵等待。图海指挥队伍猛烈攻击，布尔尼亲率大队摆列火器抗击。清军最终冲破了布尔尼的阵地，布尔尼大怒，两次组织人马进行英勇抗击，但仍不能抵挡图海队伍的连续进攻。喀尔喀公垂札布逃跑，都统晋津率部投降。布尔尼兄弟无法再战，遂在巴根等人的保护下领三十余骑突围，逃往扎鲁特境内。此时，科尔沁亲王沙津奉命率领王旗兵马到达扎鲁特旗的贵勒苏特，包围了布尔尼。

罗卜藏是沙津的妹夫，于是罗卜藏面见沙津称兄布尔尼已经逃走，自己前来乞命追踪。沙津命他先招来布尔尼方可饶命。于是遣兵三十人与罗卜藏同往。

布尔尼与罗卜藏相见后，两人一同逃走。沙津亲率骑兵追上，巴根等人誓死保护布尔南北逃，但可惜寡不敌众，布尔尼、罗不藏二人终被沙津兵射死在草原上。巴根侥幸捡回条命，带着三骑逃回察哈尔。

布尔尼死后，清廷立即将阿布奈处以死刑，同时对伙同布尔尼发动事变的察哈尔首脑，除已故死者外，都逮捕处死，另外对追随布尔尼的察哈尔左翼四旗兵丁，将其拆散后令分驻于河南府，以赎其罪。随后，再次调查各部户口，重编旗佐，改换游牧。

巴根身为布尔尼亲信，又是一旗札萨克，清廷的清算必然落到他身上，于是便在清军抵达之前率先北逃，想前往茂明安部寻求保护，因为他的亲姑姑便嫁给了茂明安首领果塞因。谁知，当他千里迢迢赶到茂明安部牧草之地时，却发现茂明安部已经不存在，在他们的草场上却新建了一座大城尼布楚，城里满是红毛绿眼吃人心的罗刹人。

不得已之下，巴根只好逃离尼布楚，寻思现在只有往漠西蒙古准噶尔部逃或者是投奔自己嫁到喀尔喀去的妹妹，怎知却在半路被罗刹人抓获，被带到了首义城从事苦力。若不是赵强带人破了首义城，巴根恐怕这辈子都只能给罗刹人当牛当马。

看到赵强他们的第一眼，巴根就知道这些汉人肯定是北逃的流犯，因为大家都是清廷追捕的人，所以巴根本能的就对这支汉人队伍产生了亲切感，看到他们不费吹灰之力就打败了罗刹人，夺下首义城，而且还要继续和罗刹人战斗。他心思活动开了，想到自己虽然逃到这里，但自己仍有数百旧部正在大漠上逃命，因此趁赵强提出拉人头的事情时，他果断的领下命令，与贺满川足足找了数月，才发现逃在大漠深处一片绿洲上的旧部们，并在清军的眼皮底下将他们成功的带到了首义城，成为关宁军骑兵的最初重要组成力量。

随着关宁军的逐步壮大，巴根的心思也在不断的活跃，终于，有一天他忍不住告诉了赵强自己的身份，并告诉赵强，他可以为关宁军找到一个更强大的盟友，有了这个盟友，关宁军一定可以成功挥师南下，抢回属于你们汉人自己的江山。

密谈了一夜，赵强与巴根相视而笑，他们谈妥了合作的条件，只待时机一到，便立即付诸实现。