太子扶苏、右丞相隗状、驷车庶长公子腾等大臣以及关东博士集团从稳定国内局势出发，奏请始皇帝马上调整政策，不要让事态继续扩大，让形势失控；左丞相李斯、太尉蒙恬、护军中尉王贲等大臣则坚持武力镇压，以维护中央权威。

就在咸阳为此事争执不下的时候，从山东传来一个惊人消息，薛郡的学府被当地儒生纵火焚毁，学府内的教授和士子死伤惨重，闻讯赶去的薛郡太守在混乱之中被人刺杀而死。

薛郡的治府就在鲁城，也就是孔氏世家的所在地，孔鲋带着儒家子弟第一个举起了反抗文化统一的大旗，也第一个引发了流血冲突。

薛郡都尉愤怒之下，当即武力镇压，当场斩杀数名儒生，抓捕了数百名孔氏弟子，羁押了孔鲋。

这一举动彻底激怒了鲁城民众。当夜鲁城暴乱，暴民和背叛的掾吏里应外合，攻占了府署，杀死了薛郡都尉，占据了鲁城。

齐王公子骧和山东镇戍统率蒙信十万火急禀奏咸阳，请求发兵平叛。

始皇帝大怒，下令山东镇戍统率蒙信火速平叛。

始皇帝下诏山东各地，以强硬手段镇制关东士人，迫不得已的情况下，允许动用武力。

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鲁城的叛乱尚未平定，从洛阳、邯郸、大梁、临淄、陈、寿春等地陆续传来关东士人在激愤之下，与当地府署发生冲突的消息，而中原的颍川郡、山东的琅琊郡，淮南的九江郡，江东的丹阳和吴县都发生了官员被刺事件，一时间关东风起云涌，局势急剧恶化。

始皇帝紧急下诏，蓝田大营十万将士即刻集结，做好东进准备。

又下诏给北军东行辕官长章邯，集结军队，随时南下平定关东地区的暴乱，确保河北安全。

两淮、江南、江东三地的镇戍军和大江一线的水师进入战备状态。

始皇帝急召武烈王公子宝鼎，请他日夜兼程从陇西赶回咸阳。

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关东地方郡国的封王和太守联合京城权贵一起向始皇帝和中枢施压，要求给地方更多的权力，尤其在地方兵役的征发上给予更大的自主权，以便应对突发事件。