军方的一些将领职务也有调整，贺兰敏之不再兼任左羽林军大将军职，在他的推荐下。程务挺转任为检校左羽林军大将军，李多祚仍为右羽林军大将军，以黑齿常之为左金吾卫大将军、李孝逸为右金吾卫大将军。李孝逸是少数没有被波及的李唐宗室之一，他在这次事件中，因为“立场”坚定，一力支持武则天。得到嘉奖，被转授右金吾卫大将军职。

另外一些将领的任命为：薛仁贵为左卫大将军，李谨行改任左领军卫大将军，被召回朝的弓仁授以左武卫大将军，得武则天特别赐婚的薛讷被授以左羽林军将军职。刘冕和李敬猷仍然执掌左右千牛卫，对贺兰敏之态度有所转变的王方翼转任左卫大将军，依然兼任兵部侍郎。

长安的乱事平静下来，武则天依然按照她早先制定的计划，准备去往东都洛阳，并改东都为神都。在她去往洛阳期间，皇帝李旦及文武百官俱随行，留尚书右仆射刘仁轨为长安留守。

在武则天宣布留刘仁轨留守长安之时，刘仁轨生了一场小病，在府中静养，武则天亲自写了封信，让人交转刘仁轨书：“昔汉以关中事委萧何，今托公亦犹是矣……”但刘仁轨上疏，以年老体衰不能胜任留守职务推辞，并陈述汉朝吕后祸败的事实，以申明对太后的劝诫之意。

贺兰敏之闻言后大怒，当着贺兰敏之的面发了一脾气，竟然就是她听从了贺兰敏之的劝，对这位老臣给予了重用，但没想到换来的还是刘仁轨的这些话，贺兰敏之只能陪着小心相劝，并说他会去劝服刘仁轨，让他安心在长安留守的……贺兰敏之带着武则天的又一封亲笔信到刘仁轨的府中拜访，他是挑了个刘冕在府中的日子去的。

“刘相，今日在下冒昧来访，打扰了你的清静，还请你见谅！”见到刘仁轨后，贺兰敏之非常客气地行了礼。待在身边的刘冕一副毕恭毕敬的样子，眼睛都不敢乱看，让贺兰敏之有点怀疑，今日让这小子陪伴是打错了如意算盘。

虽然说与刘冕是可以交心的纨绔朋友，但贺兰敏之到刘冕府上拜访的次数并不多，正大光明来拜访刘仁轨的还是第二次，上一次是几年前，也是应武则天的差遣来拜访的，目的是让刘仁轨在关键时刻不要站出来“倒武”，结果刘仁轨还真被贺兰敏之说动了，关键时候保持了沉默。

这次武则天在她将率百官前往洛阳之际，让刘仁轨留下当长安留守，这老家伙想撂挑子不干了攆，不但不想应武则天的命留下当长安留守，还想辞了尚书右仆射的职，更让人出意外的还是上书以汉之吕后事相劝谏，惹恼了武则天，贺兰敏之又来当说客了。

“秦王殿下客气了！”刘仁轨非常礼貌地回了礼，示意贺兰敏之入座，“不知今日殿下来访，有何事要指教老夫？”刘仁轨说着，对侍立在一边的刘冕使了个眼色。

刘冕只得不情愿地退下了，在离去前还对贺兰敏之示意了个只有他们明白的眼神。

“刘相，在下也不相瞒。今日来访，是奉太后的旨意，希望刘相能接了长安留守的职，”贺兰敏之说着，从怀中掏出武则天的亲笔信，交给刘仁轨，“这是太后娘娘写给你的信。请你过目！”

刘仁轨也没推托，接了过来，打开看。看了后一副复杂的神色。

“……今以皇帝谅暗不言，眇身且代亲政；远劳劝诫，复辞衰疾。又云‘吕氏见嗤于后代。禄、产贻祸于汉朝’，引喻良深，愧慰交集。公忠贞之操，始终不渝，劲直之风，古今罕比。初闻此语，能不罔然；静而思之，是为龟镜。况公先朝旧德，遐迩具瞻，愿以匡救为怀。无以暮年致请……”这是武则天写给刘仁轨信的内容，这份信措施实在在委婉了，让刘仁轨很是意外。

见刘仁轨沉默不语，贺兰敏之趁机说道：“刘相，如今朝堂乱事刚平。太后要携陛下前往神都，长安需要一位像你这样非常有威望的人镇守，原本在下是想请命留下管理长安事务，但太后觉得我太过年轻，没单独执掌过这样的事，不放心。因此希望你能留下，掌领长安的事务！太后对其他人也不放心，她最放心的是你这位老臣，在下也觉得，由你镇守长安，处理京师事务，是最适合的！”

其实武则天想留下刘仁轨镇守长安，是考虑到刘仁轨年事已高，不太会和她唱反调，也不会管事，但威望还在，所以才想到他的，并不是贺兰敏之所说的原因，具体做事的人她早已经选定，并任了职。但宣布了对刘仁轨的任命后，这倔老头却不愿意听服，还上书劝谏，让她挺是恼怒，武则天肯定不希望在她临去洛阳前，发生这样的事，一定要将这个老家伙压服。

贺兰敏之知道，如今朝中最有影响力的两位大臣就是刘仁轨和裴行俭，两人在文武两道都非常有威望。因为和他的特殊关系，裴行俭不会对武则天的行为表示反对，至多是不表态，但要是刘仁轨站出来说一些反对武则天的话，那影响力还是挺大的，在某些方面甚至诸王的影响力也不一定及他。武则天清除诸王，许多大臣并不会有危机感，但如果刘仁轨这样的大臣被武则天清除了，那许多大臣会人心惶惶，这是迫切希望朝堂稳定的武则天所不愿意看到的。