因此商毅也下令，让罗远斌将缴获的物资全部都运到九江囤积，并且准备在九府府修建水军基地，供长江舰队驻扎，做为以后的长远之计。

而就在这时，另外两条战线上，也都有好消息传来，就在罗远斌攻入江西之后，杨武丞率领着第三军，乘船从长江逆游而上，紧跟着罗远斌的进军，在九江府登陆，然后沿修水西进，从赣西的宁州进入湖广岳阳府。

其实在这个时侯，湖南、湖北只是一个地理概念，还没有一个明确的行政划分，但商毅按照后世的行政区域，以岳州府为界，岳州府以北的地区为湖北，岳州府及以南地区为湖南。

这个时候，湖广的清军由于兵力不足，几乎都集中在长江以北的地区，而在长江以南，仅仅只驻守武昌府。而在其他的地方，仅仅只是像征性的留下一点降兵驻守，有些地方根本连驻军都没有，就是由原来明朝的投降官员等全套班子付责地方的行政事务，连新的地方官员都没有任命。

而这时商家军大败清军，收复南京的消息也己经传来，在这样的情况下，谁还敢和商家军为敌，因此杨武丞的人马到达岳州府以后，几乎根本就没有遇到什么抵抗，一路的州城府县纷纷大开城打，迎接商家军到来，降清的官员、官兵们也都再次倒戈，投降商家军。

结果杨武丞也一路兵不血刃，迅速的占领了岳州府全境，并且在洞庭湖两岸的布置兵力，准备工事，以防湖北的清军进攻。并且向湖南其他各地发送檄文，各地的官员清军己败，保持地方稳定，准备迎接商家军来接收地方，不得抵抗等等。

不过几乎就在同时，岳州府也收到了广西永历朝廷发来的公文，原来永历朝廷的皇帝朱由榔己正式任命何滕蛟为湖广总督，率军进驻湖南，也要求湖南各地的官员向永历朝廷投降。

原来隆武朝廷被清军灭亡之后，何滕蛟改奉永历朝廷为正朔，在湖南兵败之后，何滕蛟退守到广西桂林府驻扎，同时招集湖南的败兵，陆陆续续又凑齐了三四万人马，而且手下还有刘承胤、张先壁、王进才、马进忠、曹志建、郝永忠等将。

因为这时永历朝廷的兵力并不多，只有滇营赵印选、胡一青部，以及焦琏、卢鼎等少数几支人马，人数还不足二万，对何腾蛟这样手握重兵的地方大员十分看重。另一方面当时清军己经攻占了整个湖南，大有接下来就进取广西之势，也正需要何腾蛟的力量，抵抗清军，因此永历朝廷并没有追究何腾蛟丢失湖南的过错，相反还对他多加安抚，并加兵部左侍郎，命何腾蛟驻守桂林，以拒清军。

何腾蛟领命之后，也开始着手布置广西的防守，命刘承胤驻守新宁、张先壁驻守东安、焦琏驻与全州等地。

其实这时清军根本就不打算进攻广西，因为在攻占了湖南之后，耿仲明就立刻被洪承畴招回到湖北，去进攻黄州府的商家军，而留守湖南的清将韩岱由于兵力不足，也一直把主力驻守在长沙一线，只是对广西发动了一次试探性的进攻，见眀军有所防范，也就撤军回湖南去了。

在这样的情况下，何腾蛟总算是守住广西，并且把清军主动撤军，吹虚成是自己率军奋战，才击退了清军的功劳。而虽然清军在湘南地区的守备十分松懈。何腾蛟也不敢轻易出兵，收取湖南之地。

而商毅宣布突袭盛京成功，并且发动了收复南京的战役等等消息传到广西之后，永历朝廷也颇为振奋，两个辅臣，首席大学士兼兵部尚书丁魁楚和东阁大学士兼吏部尚书瞿式耜也都建议，应该立刻出兵，收取湖南之地，扩大永历朝廷的地盘。

但何腾蛟在这个时候仍然心存诸多顾虑，优柔寡断犹豫不决，先是派人去湘南地区打探清军的虚实，得到的消息是清军在湖南的兵少十分空虚，就连韩岱都退回到武昌府去了，但何腾蛟还是不敢出兵，又招集众将一起商议，同时又派人潜入到荆西一带，去联系堵胤锡，共同从南北同时进军，就这样拖拖拉拉，过了一个月，但出兵连一点影子都没有见到。

而就在这时，浙江向整个南方宣布，商家军己经收复了南京，生擒了多铎，这一下子整个南方也确实都被震动了，就连朱由榔都有些坐不住了，连下了三道圣旨，催促何腾蛟出兵。