此时的刘仁轨知道武则天势大，没有与她发生冲突，有时还为武则天做事。如裴炎入狱后，郎将姜嗣宗自洛阳出使长安，刘仁轨问他洛阳的情况如何，姜嗣宗说：“嗣宗觉裴炎有异于常久矣。”仁轨曰：“使人觉之邪？”曰：“然。”刘仁轨于是说：“仁轨有奏事，愿附使人以闻。”姜嗣宗很爽快的答应了，第二天，姜嗣宗带着刘仁轨的奏章返回洛阳，结果奏章中说的是“嗣宗知裴炎反不言。”武则天看后，将姜嗣宗绞死。

垂拱元年，武则天改革官制，刘仁轨改任文昌左相、同凤阁鸾台三品。正月二十二日，刘仁轨因病去世，享年八十五岁。武则天停朝三日，让京城中的各级官员，依次前去吊唁，并追赠开府仪同三司、并州大都督，陪葬乾陵，赐其家实封三百户。

刘仁轨出身贫寒，后虽身居显位，但从不矜倨。每次接见年轻时的旧友，都是穿着很朴素的衣服。当年任陈仓尉时，相工袁天纲曾对刘仁轨说：“君终当位邻台辅，年将九十。”后果如其言。

历史上的刘仁轨素以儒将称著，当时唯裴行俭能与其相比。史书称：“昔晋侯选任将帅，取其说《礼》《乐》而敦《诗》《书》，良有以也。夫权谋方略，兵家之大经，邦国系之以存亡，政令因之而强弱，则冯众怙力，豨勇虎暴者，安可轻言推毂授任哉！故王猛、诸葛亮振起穷巷，驱驾豪杰，左指右顾，廓定霸图，非他道也，盖智力权变，适当其用耳。刘乐城、裴闻喜，文雅方略，无谢昔贤，治戎安边，绰有心术，儒将之雄者也。”

虽然史书上，因为刘仁轨晚年之时服从武则天，对他的评价不算很高，但是杜睿却对这个华夏历史上，在战场之上第一个击败倭人的将军，分外推崇。

刘仁轨虽身为文官，但在古稀之年仍能为国家建功立业，非常难能可贵。白江口海战的胜利，也使刘仁轨成为中国战争史上为数不多海军名将。在与高丽、百济的战争中，大唐统治者对东征将领可谓精加选择，充分发挥了这些军事将领的指挥和作战才能。如薛仁贵“勇冠三军”，庞同善“持军严整”，高侃“勤俭自处，忠果有谋”，契苾何力“沉毅能断”、“有统御之才”，李绩“夙夜小心，忘身忧国”等，都是唐军将帅中的佼佼者。

而刘仁轨则更要高出一畴，他不但智勇双全，而且有较高的政治才能，虽然孤立百济，却能使当地百姓“大悦”，使自己立于不败之地，为战争的最后胜利起了重要作用。

可就是这个刘仁轨，就是这个被杜睿从一介不如品级的督粮小官，一下子提拔成副帅的人，如今居然因为心怀愤懑，要起兵谋反，回顾一下历史上那个文武双全，刚正不阿的刘仁轨，杜睿都怀疑，这两者是不是同一人。

在杜睿的计划中，刘仁轨可是占着很重分量的，如今大唐在平定了吐蕃之后，又将主要的精力转移到了中南半岛之上，但是在那之后，经略海外，可就是重中之重了，到那个时候，刘仁轨这个华夏历史上的第一位海军名将，还能没有用武之地。

可是如今刘仁轨居然要谋反，杜睿一想到这个，心中又是愤怒，又是悲伤，一个大唐的英雄，居然会为了名爵上的那点儿小事，选择谋反这条路，当真可悲可叹。

“睿郎！”

方才发生的一切，让汝南公主等人都是心怀惊惧，此时见局面已经被控制住了，这才上前，担心的问道：“睿郎！可是刘仁轨要谋逆！？”

杜睿没有回答汝南公主，而是看向了李治，道：“这就要问李公子了！”

李治被杜睿的眼神一打量，倒也不心虚，坦然道：“你说的不错，那刘仁轨确实曾向我暗示过，不过我以为他是得了你的授意，才来试探我的，谁知道他居然这么大的胆子！”

杜睿并不怀疑李治的话，闻言也没有再逼问什么，只是无所谓的一笑。

一旁的安康公主急道：“坏了！？睿郎！元春和孩子们！他们……”